宁夏医科大学教务处主要负责本（专）科教学组织、教学运行、教学管理、教学改革及教学服务工作的职能机构，下设教务科、考务科、学籍管理科、教学质量监控办公室、实践教学管理科、教材科等6个科室，是一支勇于创新、锐意改革、严格管理、乐于奉献、富有朝气的教学管理团队。目前学校教师发展中心挂靠于教务处。
教务处现有15名管理人员（不含教师发展中心），其中具有研究生学历8人，占教务处人员总数的53.34％，本科学历人员7人，占46.67％；教授1人，副高职称4人，副高职称以上人员占教务处人员总数的33.3％，中级以上职称8人，占53.34％，具有副高和中级以上职称人员占86.7％。
多年来，教务处秉承 “爱国、敬业、创新、团结”的光荣传统，坚持以教育思想和教育观念的改革为先导，将提高教育教学水平和人才培养质量为立足点，紧紧把握教学质量生命线，强化教学管理，深化教学信息化建设，推动各项教学与教学管理改革，加强教学基本建设。由于工作成绩突出，连续两届获得国家级教学成果二等奖，先后被国家教育部和自治区教育厅授予“优秀教务处”荣誉称号。